Dupa Marea Unire din 1918, a avut loc reorganizarea invatamantului transilvan, iar in actualul local al liceului nostru a functionat incepand cu 11 Octombrie 1919, o scoala civila de baieti si fete.

In anul 1922 s-a luat hotararea infiintarii Seminarului Pedagogic Universitar cu un Liceu de Aplicatie care a functionat pana in 1948 si al carui continuator este liceul nostru.

In urma Dictatului de la Viena, din 30 august 1940, invatamantul romanesc din cadrul Liceului nostru a incetat temporar.

Seminarul Pedagogic Universitar si Liceul de Aplicatie, infiintat in 1922, au luat calea refugiului la Sibiu, si respectiv Timisoara.

Liceul cu sectia umanista a functionat intre 1940-1945 la Sibiu in localul Liceului "Gheorghe Lazar", avand ca director pe profesorul universitar Onisifor Ghibu, pana in 1943, apoi pe profesorul universitar Dumitru Todoran.

Sectia real s-a refugiat la Timisoara, functionand in cadrul liceului "Constantin Diaconovici Loga", sub indrumarea directorului Nicolae Apostolescu, ajutat de seful de lucrari Petre Pogacenu.

In 1945 institutiile de invatamant au revenit din refugiu, iar la 22 iunie 1945 Seminarului Pedagogic Universitar si Liceul de Aplicatie au luat in primire vechiul local de pe strada Kogalniceanu nr. 9, facandu-se pregatiri pentru deschiderea noului an scolar 1945-1946, care a inceput la 15 octombrie cu clasele I-VIII, avand incadrati 23 de profesori, 4 pedagogi, si 4 persoane de serviciu.

Profesor de istorie a fost viitorul academician Stefan Pascu.

Pana in 1948 s-a aplicat planul de invatamant din perioada interbelica, cu mici exceptii, mentinandu-se sectiile reala si umana.

In anul scolar 1946-1947, Liceul de Aplicatie avea in clasele I-VIII (V-XII) 219 elevi, printre care il gasim pe viitorul profesor universitar Hadrian Daicoviciu, si pe actorul Florin Persic.

Intre 1945-1948, director al Liceului de Aplicatie a fost Petre Pogaceanu, care era asistent la Universitate, si care a ramas strans legat de Liceul "Emil Racovita" pana la sfarsitul vietii.

Anul 1948 aducea asa-zisa reforma a invatamantului, stabilizarea facandu-se simtita si in acest domeniu.

Invatamantul este reorganizat astfel: invatamantul primar (clasele I-IV), invatamantul elementar (clasele V-VII), si invatamantul liceal (clasele VIII-XI).

In aceasta situatie, Seminarul Pedagogic Universitar si Liceul de Aplicatie isi inceteaza activitatea, fiind desfiintate.

In locul lor se infiinteaza Liceul de baieti nr. 3, cu clasele I-XI care a functionat pana in 1954, cand a primit denumirea de Scoala Medie nr. 4, fiind organizata dupa model sovietic, cu o durata de 10 ani, functionand in aceasta forma pana in 1957.

Din 1958, s-a revenit la invatamantul de 11 clase, iar denumirea scolii era Scoala Medie "Emil Racovita", iar putin mai tarziu, Liceul Teoretic "Emil Racovita".

S-a dat aceasta denumire scolii in semn de pretuire pentru aportul marelui savant la organizarea invatamantului clujean dupa 1918.

Un alt motiv ar putea fi acela ca acesta a locuit dupa stabilirea la Cluj pe strada Kogalniceanu, strada pe care se afla si liceul nostru.

Din 1968 s-a revenit la invatamantul liceal de 12 clase, asa cum era inainte de 1948. Aici au predominat clasele cu profil real, dar a existat si sectia umanista, iar in anii 1970 a avut si clase speciale de fizica.

In 1990, a revenit la vechiul statul de liceu teoretic, cu profil real si uman.

Din 1999, este Liceu Teoretic cu clase de matematica – informatica si clase de stiinte ale naturii.

In toamna anului 2000, liceul nostru a primit titlul de Colegiul National, fapt care certifica reputatia de care se bucura aceasta unitate de invatamant.

Marea majoritate a absolventilor acestei scoli de la infiintare si pana in prezent au urmat invatamantul superior, iar multi au devenit personalitati de seama ale vietii stiintifice si culturale, fiind bine cunoscuti in tara si in strainatate.

Printre aceatia se numara: acad. Hadrian Daicoviciu, acad. Ionel Haiduc, acad. dr. Nicolae Ghilezan, acad.Ioan Sielberg, acad. Dan Munteanu, prof. dr. Alexandru Bologa, prof. dr. Nicolae Maier, prof .dr. Emil Cordos, prof.dr. Simon Simion, prof. dr. Ioan Pop, prof. dr. Ioan Hangut, prof. dr. Miron Costin, prof. dr. Andrei Rapeanu, prof. dr. Nicolae Miu, scriitorii Aurel Rau, Alexandru Filipascu, Adrian Dohotaru, actorul Florin Piersic si multi altii.